El color de los ojos es el color del iris, la parte coloreada que rodea la pupila (la pequeña mancha negra en el centro del ojo). Es un hecho interesante que cada persona tiene un color de ojos único, similar a las huellas dactilares.

El color de ojos más común es el marrón, seguido del azul, el verde o el avellana. Además, el iris puede ser de un color mixto, como marrón con amarillo, marrón con verde o marrón con azul.
El iris se encuentra dentro del ojo, debajo de una capa transparente e incolora llamada córnea que tiene menos de medio milímetro de espesor. El iris contiene muchas células, músculos especiales, vasos sanguíneos y nervios. Alrededor del iris hay una sustancia viscosa con millones de fibras diminutas que se entrecruzan entre sí.
El cuerpo humano sólo produce pigmento del iris marrón (melanina), no pigmento del iris azul, verde o avellana.
Las células pigmentarias del iris contienen melanosomas. Todos los colores del iris tienen el mismo número de células pigmentarias, pero los gránulos de pigmento dentro de las células son diferentes; por ejemplo, los iris marrones tienen más gránulos de pigmento que los iris azules.
Otras células del iris producen pequeñas fibras y moco en el iris que ayudan a protegerlo de daños. La pupila puede contraerse o dilatarse gracias a unos músculos especiales del iris con fibras elásticas.
La parte posterior del iris es una superficie oscura con células llenas de pigmento de la superficie posterior que ayuda a evitar que la luz se disperse a través del iris, lo que es bueno para la visión.
La luz blanca contiene un espectro de colores del arco iris que van del azul al rojo. Cuando la luz pasa a través del iris, la luz azul se dispersa más que otros colores y se refleja. Entonces, si hay menos gránulos de pigmento, veremos ese iris de color azul.
Los demás colores de la luz, especialmente el rojo, se dispersan menos y entran en el iris entre las fibras, el moco y las células. Por eso, los ojos verdes, color avellana o marrones tienen más de este pigmento que absorbe la luz.
Por lo tanto, es el resultado de que algunos colores dispersan más o menos luz que otros combinado con las partículas de pigmento marrón que absorben más de algunos colores y la cantidad de partículas de pigmento que determina el color de ojos de una persona.

El color del iris no permanece igual durante toda la vida, sino que puede cambiar debido a los pigmentos oscuros que se producen en las células del iris después del nacimiento. Por ejemplo, un recién nacido con ojos azules puede volverse marrón o avellana al cabo de sólo un día de vida.
Ciertas enfermedades o lesiones también pueden provocar el cambio de color del iris.
Algunas personas nacen con un ojo marrón y otro azul, y esto nunca cambia a lo largo de sus vidas. La causa de esto aún se desconoce.